Sur le chemin du marché, Sam et son grand-père tombent sur un cirque dans lequel ils découvrent un Mogwai. S'ils ne mettent pas vite la main dessus, Shanghai court à sa perte ! Il se lancent alors à sa poursuite.
Tandis que les parents de Sam deviennent les prisonniers de Greene, Sam et Elle vont s'associer et partir pour Fengdong, dans le but de ramener Gizmo chez lui dans la Vallée de Jade.
Sam et Elle se retrouvent à bord d'un train, en direction de la vallée de Jade; ils croisent la route d'une métamorphose qui va tout faire pour s'emparer de Gizmo.
Alors que Sam et Elle se croient en sécurité dans la Vallée de Jade, où Gizmo retrouvent les siens, Greene fait son apparition et parvient à s'emparer du couteau de la création.
C'est le chaos dans les rues de Shanghai où les méchants Gremlins s'en donnent à coeur joie... Sam, Elle et Gizmo réussiront-ils à récupérer le couteau de la création ? Et Greene retrouvera-t-il ses mains ?